Protein–RNA interactions for Protein: Q12400

TRM10, tRNA (guanine(9)-N1)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10Q12400 LRE1YCL051W 1752 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 VMR1YHL035C 4779 nt1.71□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 FAB1YFR019W 6837 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 IPT1YDR072C 1584 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 MET32YDR253C 576 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YHR210CYHR210C 1026 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SVS1YPL163C 783 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 IRC16YPR038W 360 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 NUP82YJL061W 2142 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 PEP1YBL017C 4740 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SPR3YGR059W 1539 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 VPS8YAL002W 3825 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 RTT101YJL047C 2529 nt1.7□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 MZM1YDR493W 372 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 NCE101YJL205C 162 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SPC1YJR010C-A 285 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 ATP7YKL016C 525 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 GRX8YLR364W 330 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 LOA1YPR139C 903 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 RPB5YBR154C 648 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 NIC96YFR002W 2520 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 VPH1YOR270C 2523 nt1.69□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YJL016WYJL016W 1686 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YDL068WYDL068W 330 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 MGA2YIR033W 3342 nt1.68□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 VPS15YBR097W 4365 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SMB1YER029C 591 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SMD1YGR074W 441 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YKL111CYKL111C 336 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 PKR1YMR123W 369 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YMR324CYMR324C 243 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YNL010WYNL010W 726 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YOR333CYOR333C 417 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 RUD3YOR216C 1455 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 PDR8YLR266C 2106 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SPE1YKL184W 1401 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 HOP2YGL033W 657 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 COX13YGL191W 390 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 EMP24YGL200C 612 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YGR290WYGR290W 444 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 RPC10YHR143W-A 213 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YJR079WYJR079W 330 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 EAF6YJR082C 342 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 IRC19YLL033W 693 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 TMA7YLR262C-A 195 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 GPI15YNL038W 690 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 ROX1YPR065W 1107 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 TRL1YJL087C 2484 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.66□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 SPO22YIL073C 2928 nt1.65□□□□□ -2.14
TRM10Q12400 CDC53YDL132W 2448 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 ATG9YDL149W 2994 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 CAJ1YER048C 1176 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 RPL9AYGL147C 576 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 VOA1YGR106C 798 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MSL1YIR009W 336 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 RTC6YPL183W-A 282 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 HER1YOR227W 3741 nt1.65□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YGR018CYGR018C 330 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 Q0144Q0144 330 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YAP3YHL009C 993 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 CTK3YML112W 891 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 DDR48YMR173W 1293 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 COX7YMR256C 183 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 NOP15YNL110C 663 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YOR392WYOR392W 444 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.64□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MNE1YOR350C 1992 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MYO2YOR326W 4725 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 LSO2YGR169C-A 279 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 SEN15YMR059W 387 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MRPL44YMR225C 297 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MET18YIL128W 3099 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 VPS52YDR484W 1926 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 SOK2YMR016C 2358 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 SPC72YAL047C 1869 nt1.63□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 IRA1YBR140C 9279 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 RPI1YIL119C 1224 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YLR053CYLR053C 327 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 LCL2YLR104W 396 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 SEC22YLR268W 645 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 HSL1YKL101W 4557 nt1.62□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YDL041WYDL041W 354 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 SPC29YPL124W 762 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 MYO4YAL029C 4416 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 YDR341CYDR341C 1824 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 VPS35YJL154C 2835 nt1.61□□□□□ -2.15
TRM10Q12400 RTT107YHR154W 3213 nt1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms