Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YLR031WYLR031W 561 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 SWS2YNL081C 432 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YPR147CYPR147C 915 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YNL144CYNL144C 2223 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CFT1YDR301W 4074 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 IRC10YOL015W 1761 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CHZ1YER030W 462 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YHR210CYHR210C 1026 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 BUD19YJL188C 309 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 TIM8YJR135W-A 264 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 TBS1YBR150C 3285 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 BI4Q0120 1917 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CHC1YGL206C 4962 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 SWT1YOR166C 1377 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 AFR1YDR085C 1863 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 STB4YMR019W 2850 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CAT2YML042W 2013 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YGL015CYGL015C 393 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 SLX9YGR081C 633 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 VOA1YGR106C 798 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 TIM10YHR005C-A 282 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 LRP1YHR081W 555 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 TEN1YLR010C 483 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 LCL2YLR104W 396 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 PHO80YOL001W 882 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 SYH1YPL105C 2550 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YDR341CYDR341C 1824 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 MEC1YBR136W 7107 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CRD1YDL142C 852 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 RPA34YJL148W 702 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 NCE101YJL205C 162 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YLR255CYLR255C 354 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 FYV12YOR183W 390 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 NUP82YJL061W 2142 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CDC60YPL160W 3273 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 OCA6YDR067C 675 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YLR271WYLR271W 825 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YML084WYML084W 309 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CSI1YMR025W 888 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 MYO4YAL029C 4416 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 DNF3YMR162C 4971 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 CRM1YGR218W 3255 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YDL062WYDL062W 426 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 MZM1YDR493W 372 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 HSK3YKL138C-A 210 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YLR252WYLR252W 306 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 RTC6YPL183W-A 282 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 GRR1YJR090C 3456 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YOR093CYOR093C 4947 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 PLC1YPL268W 2610 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 KIP1YBL063W 3336 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YDL068WYDL068W 330 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YDR042CYDR042C 603 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 BNA7YDR428C 786 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YKL123WYKL123W 381 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YMR324CYMR324C 243 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YPL039WYPL039W 951 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 VMR1YHL035C 4779 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YPL238CYPL238C 390 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 TRM3YDL112W 4311 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 CDC27YBL084C 2277 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 HER1YOR227W 3741 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 HSH155YMR288W 2916 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YDL016CYDL016C 303 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YDR220CYDR220C 294 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YGL024WYGL024W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YIL029CYIL029C 429 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 RPL37AYLR185W 267 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YNL010WYNL010W 726 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 SNC2YOR327C 348 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 ARP7YPR034W 1434 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 BTT1YDR252W 450 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YGL069CYGL069C 465 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 HCS1YKL017C 2052 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 PKH3YDR466W 2697 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 SPO13YHR014W 876 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 GMC2YLR445W 567 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 CYB5YNL111C 363 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YOR146WYOR146W 306 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YPL197CYPL197C 414 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 UTP13YLR222C 2454 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 NAM7YMR080C 2916 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 AFB1YLR040C 675 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 SEC22YLR268W 645 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP42Q12277 SFB2YNL049C 2631 nt1.59□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RIC1YLR039C 3171 nt1.59□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.59□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 NUP192YJL039C 5052 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.5 ms