Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 MSB2YGR014W 3921 nt3.2□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 URB2YJR041C 3525 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 LEU3YLR451W 2661 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 CHS2YBR038W 2892 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 TOP1YOL006C 2310 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YDL041WYDL041W 354 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 HPA3YEL066W 540 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 snR48snR48 113 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YLL032CYLL032C 2478 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 KAP95YLR347C 2586 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 NUP82YJL061W 2142 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YPK1YKL126W 2043 nt3.19□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 DRS2YAL026C 4068 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 snR79snR79 84 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YDL242WYDL242W 354 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 ERP6YGL002W 651 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 CCW14YLR390W-A 717 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 RPS18BYML026C 441 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YNL034WYNL034W 1839 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 BIT61YJL058C 1632 nt3.18□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 BFA1YJR053W 1725 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 PAU2YEL049W 363 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YIL058WYIL058W 285 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YJL135WYJL135W 318 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YPR014CYPR014C 330 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 PRP39YML046W 1890 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 SMC2YFR031C 3513 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 TMA108YIL137C 2841 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 ILS1YBL076C 3219 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 ECM5YMR176W 4236 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 CIN1YOR349W 3045 nt3.17□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 STN1YDR082W 1485 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 FAS1YKL182W 6156 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 TIM13YGR181W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YHL005CYHL005C 393 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 GYL1YMR192W 2163 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 SEC15YGL233W 2733 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YKU70YMR284W 1809 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 GYP7YDL234C 2241 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 FLO9YAL063C 3969 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 ARG2YJL071W 1725 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 MNT3YIL014W 1893 nt3.16□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 YCG1YDR325W 3108 nt3.15□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 NPR1YNL183C 2373 nt3.15□□□□□ -1.9
DUS4Q06063 SPO14YKR031C 5052 nt3.15□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 SIP3YNL257C 3690 nt3.15□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YPR146CYPR146C 330 nt3.15□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 ENA5YDR038C 3276 nt3.15□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 SOK2YMR016C 2358 nt3.15□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 GCD6YDR211W 2139 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 DNA2YHR164C 4569 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 snR60snR60 104 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YFL065CYFL065C 309 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 PRE4YFR050C 801 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YML037CYML037C 1023 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 CYB5YNL111C 363 nt3.14□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 CHS3YBR023C 3498 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPL6AYML073C 531 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 ATP25YMR098C 1839 nt3.13□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YIL169CYIL169C 2988 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 TCP1YDR212W 1680 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YLR053CYLR053C 327 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RSM19YNR037C 276 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPS7AYOR096W 573 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YJL181WYJL181W 1836 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 ECM25YJL201W 1800 nt3.12□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 CCM1YGR150C 2595 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 FUN30YAL019W 3396 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPS23AYGR118W 438 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 SAR1YPL218W 573 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPS23BYPR132W 438 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 snR43snR43 209 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RAX2YLR084C 3663 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 TAF2YCR042C 4224 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YIL166CYIL166C 1629 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 BRO1YPL084W 2535 nt3.11□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 CDC24YAL041W 2565 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 STT4YLR305C 5703 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 SQS1YNL224C 2304 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 CSR2YPR030W 3366 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YGL239CYGL239C 315 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YLR140WYLR140W 327 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 snR191snR191 274 nt3.1□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YAK1YJL141C 2424 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 PMR1YGL167C 2853 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YGR164WYGR164W 336 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPS28BYLR264W 204 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 RPL36AYMR194W 303 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 YNL010WYNL010W 726 nt3.09□□□□□ -1.91
DUS4Q06063 TFB1YDR311W 1929 nt3.09□□□□□ -1.92
DUS4Q06063 RPS17BYDR447C 411 nt3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.4 ms