Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 BUD19YJL188C 309 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YJR141WYJR141W 1044 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 RTC6YPL183W-A 282 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YFR016CYFR016C 3702 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 BRE1YDL074C 2103 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 SOK2YMR016C 2358 nt2.05□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 STB4YMR019W 2850 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 BPH1YCR032W 6504 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 UFD4YKL010C 4452 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 VMR1YHL035C 4779 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YDL062WYDL062W 426 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 HNT1YDL125C 477 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 RTR2YDR066C 591 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 RPS24AYER074W 408 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 PRM8YGL053W 714 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 RLP24YLR009W 600 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YMR324CYMR324C 243 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 SNC2YOR327C 348 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 MEI5YPL121C 669 nt2.04□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 IRC20YLR247C 4671 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YPS5YGL259W 498 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 PAU14YIL176C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 PAU1YJL223C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 YKL044WYKL044W 321 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 CDC27YBL084C 2277 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 RIC1YLR039C 3171 nt2.03□□□□□ -2.08
CIK1Q01649 HER1YOR227W 3741 nt2.03□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YJL016WYJL016W 1686 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MGA2YIR033W 3342 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 NEO1YIL048W 3456 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 snR84snR84 550 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 ILM1YJR118C 612 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 UBX4YMR067C 1251 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 RCN2YOR220W 798 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 snR189snR189 189 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 DIS3YOL021C 3006 nt2.02□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 NAM7YMR080C 2916 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SWT1YOR166C 1377 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YGL069CYGL069C 465 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 KOG1YHR186C 4674 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 HSK3YKL138C-A 210 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SEC22YLR268W 645 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 DGK1YOR311C 873 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YPR153WYPR153W 423 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SPR3YGR059W 1539 nt2.01□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 FKS1YLR342W 5631 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 IRC19YLL033W 693 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SEN15YMR059W 387 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MYO2YOR326W 4725 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 HSL1YKL101W 4557 nt2□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MUD2YKL074C 1584 nt1.99□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 HCS1YKL017C 2052 nt1.99□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MET32YDR253C 576 nt1.99□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 EMC4YGL231C 573 nt1.99□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YKL111CYKL111C 336 nt1.99□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 PLC1YPL268W 2610 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 VPS52YDR484W 1926 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 RPC10YHR143W-A 213 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YJR079WYJR079W 330 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 TMA7YLR262C-A 195 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YBL012CYBL012C 402 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 CYB5YNL111C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SVS1YPL163C 783 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 PET309YLR067C 2898 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SET2YJL168C 2202 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 RPH1YER169W 2391 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 IRC10YOL015W 1761 nt1.98□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MYO4YAL029C 4416 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 YDL041WYDL041W 354 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 BTT1YDR252W 450 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 LSO2YGR169C-A 279 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 MRPL44YMR225C 297 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 GPX2YBR244W 489 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 ARP7YPR034W 1434 nt1.97□□□□□ -2.09
CIK1Q01649 SNU56YDR240C 1479 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 APL5YPL195W 2799 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 BRP1YGL007W 378 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 CIC1YHR052W 1131 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 STE18YJR086W 333 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 YPL238CYPL238C 390 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 PUT3YKL015W 2940 nt1.96□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 KAR3YPR141C 2190 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 SAP190YKR028W 3102 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 VTC1YER072W 390 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 RPA34YJL148W 702 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 SPC29YPL124W 762 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 IRC16YPR038W 360 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 SLN1YIL147C 3663 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 YLR149CYLR149C 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 SGD1YLR336C 2700 nt1.94□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 PHR1YOR386W 1698 nt1.94□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 NOT5YPR072W 1683 nt1.94□□□□□ -2.1
CIK1Q01649 SMB1YER029C 591 nt1.94□□□□□ -2.1
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