Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 BUD19YJL188C 309 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 CYB5YNL111C 363 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YPL080CYPL080C 327 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YBR063CYBR063C 1215 nt1.57□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YDR042CYDR042C 603 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YLR255CYLR255C 354 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 PHO80YOL001W 882 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 ROX1YPR065W 1107 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 BPH1YCR032W 6504 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 CFT1YDR301W 4074 nt1.56□□□□□ -2.16
DDI1P40087 CDC27YBL084C 2277 nt1.55□□□□□ -2.16
DDI1P40087 MND1YGL183C 660 nt1.55□□□□□ -2.16
DDI1P40087 VOA1YGR106C 798 nt1.55□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YCL007CYCL007C 393 nt1.55□□□□□ -2.16
DDI1P40087 VPS35YJL154C 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RIC1YLR039C 3171 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 PAU3YCR104W 375 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 BNA7YDR428C 786 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 TMA20YER007C-A 546 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SPO11YHL022C 1197 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YHR054CYHR054C 1065 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SEC28YIL076W 891 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 LCL2YLR104W 396 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 URA10YMR271C 684 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RPS7BYNL096C 573 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SNC2YOR327C 348 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SAR1YPL218W 573 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 BRR2YER172C 6492 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 Q0255Q0255 1419 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 TFC8YPL007C 1767 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 YBP1YBR216C 2025 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 DNF3YMR162C 4971 nt1.54□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RNR4YGR180C 1038 nt1.53□□□□□ -2.16
DDI1P40087 MUD2YKL074C 1584 nt1.53□□□□□ -2.16
DDI1P40087 CSI1YMR025W 888 nt1.53□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SPC29YPL124W 762 nt1.53□□□□□ -2.16
DDI1P40087 RTC6YPL183W-A 282 nt1.53□□□□□ -2.16
DDI1P40087 SFB2YNL049C 2631 nt1.53□□□□□ -2.17
DDI1P40087 SEC63YOR254C 1992 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 GUP1YGL084C 1683 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 MON2YNL297C 4911 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YOR093CYOR093C 4947 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 SBE22YHR103W 2559 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 RPL31AYDL075W 342 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 snR78snR78 87 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 PRE4YFR050C 801 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YGL069CYGL069C 465 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 AIM18YHR198C 966 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 CMS1YLR003C 876 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YOR146WYOR146W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 MSH6YDR097C 3729 nt1.52□□□□□ -2.17
DDI1P40087 HIR3YJR140C 4947 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 ATP17YDR377W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YGR228WYGR228W 345 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 TIM8YJR135W-A 264 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YHC1YLR298C 696 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YPR172WYPR172W 603 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 NUP82YJL061W 2142 nt1.51□□□□□ -2.17
DDI1P40087 PET127YOR017W 2403 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 TDA9YML081W 3756 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 snR9snR9 187 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YMR254CYMR254C 309 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YNL050CYNL050C 813 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YPL039WYPL039W 951 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 TBS1YBR150C 3285 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 MDM32YOR147W 1869 nt1.5□□□□□ -2.17
DDI1P40087 NUP192YJL039C 5052 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 CCH1YGR217W 6120 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YDL068WYDL068W 330 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 GIC1YHR061C 945 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 CMC2YBL059C-A 330 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YMR324CYMR324C 243 nt1.49□□□□□ -2.17
DDI1P40087 ECM9YKR004C 1134 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 TRX1YLR043C 312 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 RPL37AYLR185W 267 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 RPB11YOL005C 363 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 FYV8YGR196C 2454 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 NOT5YPR072W 1683 nt1.48□□□□□ -2.17
DDI1P40087 NCE101YJL205C 162 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 CSM4YPL200W 471 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 ATP20YPR020W 348 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 GPX2YBR244W 489 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 SEY1YOR165W 2331 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 ZRG8YER033C 3231 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 CHS1YNL192W 3396 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 DAS1YJL149W 1992 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 ASM4YDL088C 1587 nt1.47□□□□□ -2.17
DDI1P40087 BI4Q0120 1917 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 ADR1YDR216W 3972 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 MNL2YLR057W 2550 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 RTR2YDR066C 591 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SEC22YLR268W 645 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 TIF11YMR260C 462 nt1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.7 ms