Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms