Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SYNE4Q8N205 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE4Q8N205 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms