RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613850.4

GGTLC2-204, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-204ENST00000613850 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.39■■■■■ 5.34
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GGTLC2-204ENST00000613850 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
GGTLC2-204ENST00000613850 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.39■■■■■ 4.06
GGTLC2-204ENST00000613850 NACADO15069 1562 aa40.38■■■■■ 4.05
GGTLC2-204ENST00000613850 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
GGTLC2-204ENST00000613850 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.19■■■■■ 4.02
GGTLC2-204ENST00000613850 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.07■■■■■ 4.01
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GGTLC2-204ENST00000613850 SCRIBQ14160 1630 aa39.21■■■■□ 3.87
GGTLC2-204ENST00000613850 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.14■■■■□ 3.86
GGTLC2-204ENST00000613850 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.08■■■■□ 3.85
GGTLC2-204ENST00000613850 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.79■■■■□ 3.8
GGTLC2-204ENST00000613850 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.21■■■■□ 3.71
GGTLC2-204ENST00000613850 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
GGTLC2-204ENST00000613850 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.87■■■■□ 3.65
GGTLC2-204ENST00000613850 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.64■■■■□ 3.62
GGTLC2-204ENST00000613850 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
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GGTLC2-204ENST00000613850 SMARCA2P51531 1590 aa37.28■■■■□ 3.56
GGTLC2-204ENST00000613850 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.27■■■■□ 3.56
GGTLC2-204ENST00000613850 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.27■■■■□ 3.56
GGTLC2-204ENST00000613850 NCAPD3P42695 1498 aa37.24■■■■□ 3.55
GGTLC2-204ENST00000613850 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
GGTLC2-204ENST00000613850 HMGXB3Q12766 1538 aa37.09■■■■□ 3.53
GGTLC2-204ENST00000613850 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
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GGTLC2-204ENST00000613850 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.25■■■■□ 3.39
GGTLC2-204ENST00000613850 NESP48681 1621 aa36.25■■■■□ 3.39
GGTLC2-204ENST00000613850 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.17■■■■□ 3.38
GGTLC2-204ENST00000613850 ERCC6Q03468 1493 aa36.14■■■■□ 3.38
GGTLC2-204ENST00000613850 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
GGTLC2-204ENST00000613850 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.09■■■■□ 3.37
GGTLC2-204ENST00000613850 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.02■■■■□ 3.36
GGTLC2-204ENST00000613850 CFTRP13569 1480 aa35.99■■■■□ 3.35
GGTLC2-204ENST00000613850 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.84■■■■□ 3.33
GGTLC2-204ENST00000613850 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.76■■■■□ 3.32
GGTLC2-204ENST00000613850 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.72■■■■□ 3.31
GGTLC2-204ENST00000613850 PRDM2Q13029 1718 aa35.71■■■■□ 3.31
GGTLC2-204ENST00000613850 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
GGTLC2-204ENST00000613850 CUX2O14529 1486 aa35.68■■■■□ 3.3
GGTLC2-204ENST00000613850 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.62■■■■□ 3.29
GGTLC2-204ENST00000613850 WDR62O43379 1518 aa35.48■■■■□ 3.27
GGTLC2-204ENST00000613850 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCC8Q09428 1581 aa35.25■■■■□ 3.23
GGTLC2-204ENST00000613850 TOPBP1Q92547 1522 aa35.19■■■■□ 3.22
GGTLC2-204ENST00000613850 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.18■■■■□ 3.22
GGTLC2-204ENST00000613850 CUX1P39880 1505 aa34.96■■■■□ 3.19
GGTLC2-204ENST00000613850 IFT140Q96RY7 1462 aa34.96■■■■□ 3.19
GGTLC2-204ENST00000613850 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
GGTLC2-204ENST00000613850 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
GGTLC2-204ENST00000613850 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
GGTLC2-204ENST00000613850 SOGA1O94964 1423 aa34.78■■■■□ 3.16
GGTLC2-204ENST00000613850 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
GGTLC2-204ENST00000613850 TOP2BQ02880 1626 aa34.74■■■■□ 3.15
GGTLC2-204ENST00000613850 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.73■■■■□ 3.15
GGTLC2-204ENST00000613850 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
GGTLC2-204ENST00000613850 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.72■■■■□ 3.15
GGTLC2-204ENST00000613850 SYNJ1O43426 1573 aa34.7■■■■□ 3.15
GGTLC2-204ENST00000613850 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
GGTLC2-204ENST00000613850 WDR97A6NE52 1622 aa34.58■■■■□ 3.13
GGTLC2-204ENST00000613850 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.57■■■■□ 3.12
GGTLC2-204ENST00000613850 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.52■■■■□ 3.12
GGTLC2-204ENST00000613850 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
GGTLC2-204ENST00000613850 GRIN2BQ13224 1484 aa34.37■■■■□ 3.09
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.36■■■■□ 3.09
GGTLC2-204ENST00000613850 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.35■■■■□ 3.09
GGTLC2-204ENST00000613850 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.28■■■■□ 3.08
GGTLC2-204ENST00000613850 PBRM1Q86U86 1689 aa34.28■■■■□ 3.08
GGTLC2-204ENST00000613850 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
GGTLC2-204ENST00000613850 OSCARQ8IYS5 282 aa34.23■■■■□ 3.07
GGTLC2-204ENST00000613850 FBLN2P98095 1184 aa34.17■■■■□ 3.06
GGTLC2-204ENST00000613850 TRIM41Q8WV44 630 aa34.15■■■■□ 3.06
GGTLC2-204ENST00000613850 CHD1O14646 1710 aa34.14■■■■□ 3.06
GGTLC2-204ENST00000613850 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.13■■■■□ 3.05
GGTLC2-204ENST00000613850 SYNJ2O15056 1496 aa34.13■■■■□ 3.05
GGTLC2-204ENST00000613850 KIF27Q86VH2 1401 aa34.13■■■■□ 3.05
GGTLC2-204ENST00000613850 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
GGTLC2-204ENST00000613850 ADAMTS12P58397 1594 aa34.03■■■■□ 3.04
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GGTLC2-204ENST00000613850 GRIN2AQ12879 1464 aa33.91■■■■□ 3.02
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GGTLC2-204ENST00000613850 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.79■■■■□ 3
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GGTLC2-204ENST00000613850 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.77■■■■□ 3
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GGTLC2-204ENST00000613850 NUP160Q12769 1436 aa33.74■■■□□ 2.99
GGTLC2-204ENST00000613850 CEP170Q5SW79 1584 aa33.71■■■□□ 2.99
GGTLC2-204ENST00000613850 ARHGEF11O15085 1522 aa33.65■■■□□ 2.98
GGTLC2-204ENST00000613850 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.62■■■□□ 2.97
GGTLC2-204ENST00000613850 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.62■■■□□ 2.97
GGTLC2-204ENST00000613850 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.62■■■□□ 2.97
GGTLC2-204ENST00000613850 EEA1Q15075 1411 aa33.6■■■□□ 2.97
GGTLC2-204ENST00000613850 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.57■■■□□ 2.97
GGTLC2-204ENST00000613850 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.49■■■□□ 2.95
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