Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 GIS1YDR096W 2685 nt2.53□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 SWA2YDR320C 2007 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 SNU114YKL173W 3027 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 ISW1YBR245C 3390 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 KRE33YNL132W 3171 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YGR045CYGR045C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RNR4YGR180C 1038 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YAP3YHL009C 993 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RPL16AYIL133C 600 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 HSC82YMR186W 2118 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 IRC8YJL051W 2469 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 HSH155YMR288W 2916 nt2.52□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 ARP7YPR034W 1434 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 VPS16YPL045W 2397 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 ROY1YMR258C 1662 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RAM2YKL019W 951 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YLR458WYLR458W 381 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 MRPL44YMR225C 297 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 IGO1YNL157W 507 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 ATP19YOL077W-A 207 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 MGR1YCL044C 1254 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 BRO1YPL084W 2535 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RGL1YPL066W 1440 nt2.51□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 GPI15YNL038W 690 nt2.5□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YPL197CYPL197C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YPK1YKL126W 2043 nt2.5□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YKU80YMR106C 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YJL181WYJL181W 1836 nt2.49□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 PBI2YNL015W 228 nt2.49□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 PET123YOR158W 957 nt2.49□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YFR016CYFR016C 3702 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 MXR1YER042W 555 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RPF1YHR088W 888 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YKR051WYKR051W 1257 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 FYV7YLR068W 456 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YOR105WYOR105W 327 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 IRC16YPR038W 360 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 CBF2YGR140W 2871 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YJR098CYJR098C 1971 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 SAP185YJL098W 3177 nt2.48□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YEL043WYEL043W 2871 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 IRA2YOL081W 9240 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 HYP2YEL034W 474 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 TWF1YGR080W 999 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YHR130CYHR130C 336 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 RPL40AYIL148W 387 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 CTK3YML112W 891 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YBR277CYBR277C 402 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 UFD4YKL010C 4452 nt2.47□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 YJL070CYJL070C 2667 nt2.46□□□□□ -2.01
CTI6Q08923 UBP11YKR098C 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 ORC2YBR060C 1863 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SMB1YER029C 591 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YFR056CYFR056C 369 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YPS5YGL259W 498 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 PKR1YMR123W 369 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 RPS7BYNL096C 573 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 RRP12YPL012W 3687 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 CSF1YLR087C 8877 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 KOG1YHR186C 4674 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 TAE2YPL009C 3117 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 PRK1YIL095W 2433 nt2.46□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 TRS130YMR218C 3309 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 BIG1YHR101C 1008 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 TIM8YJR135W-A 264 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YMR320WYMR320W 306 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 NOP15YNL110C 663 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 ATX2YOR079C 942 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 EDS1YBR033W 2760 nt2.44□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SCH9YHR205W 2475 nt2.44□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 DGR1YNL130C-A 147 nt2.44□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 REV1YOR346W 2958 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 PSD2YGR170W 3417 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 BNA7YDR428C 786 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SHE2YKL130C 741 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 RMP1YLR145W 606 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 ACM1YPL267W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 ATP15YPL271W 189 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SSD1YDR293C 3753 nt2.43□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SPE1YKL184W 1401 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 NUP100YKL068W 2880 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YDR239CYDR239C 2364 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 NCL1YBL024W 2055 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 FMP16YDR070C 282 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 COX13YGL191W 390 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 YJR079WYJR079W 330 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 DDR48YMR173W 1293 nt2.42□□□□□ -2.02
CTI6Q08923 SHE9YDR393W 1371 nt2.41□□□□□ -2.02
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