Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 PSY1YKL076C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 PAU8YAL068C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 PAU20YOL161C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 MDM32YOR147W 1869 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RAV1YJR033C 4074 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RPL9AYGL147C 576 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 CBF2YGR140W 2871 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YLR458WYLR458W 381 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YOR105WYOR105W 327 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 REV1YOR346W 2958 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 GIP3YPL137C 3831 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 SCP160YJL080C 3669 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN9P53437 SPP41YDR464W 4308 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 NCL1YBL024W 2055 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 MSL5YLR116W 1431 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 BNA7YDR428C 786 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RPL27BYDR471W 411 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YKL111CYKL111C 336 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 SHE2YKL130C 741 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 CMS1YLR003C 876 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YLR031WYLR031W 561 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 CCW14YLR390W-A 717 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 YNL010WYNL010W 726 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RPS7BYNL096C 573 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 NOP15YNL110C 663 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RPB11YOL005C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 USO1YDL058W 5373 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN9P53437 RGA2YDR379W 3030 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 SLN1YIL147C 3663 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RPL16AYIL133C 600 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 GPI15YNL038W 690 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 DGK1YOR311C 873 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 ATP15YPL271W 189 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 CLN3YAL040C 1743 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 UBR1YGR184C 5853 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN9P53437 MZM1YDR493W 372 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YPS5YGL259W 498 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RRF1YHR038W 693 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN9P53437 TIM8YJR135W-A 264 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN9P53437 PRK1YIL095W 2433 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 CDC50YCR094W 1176 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YAP3YHL009C 993 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RPL40AYIL148W 387 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 LCL2YLR104W 396 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RMP1YLR145W 606 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YLR379WYLR379W 375 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 PKR1YMR123W 369 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YNL122CYNL122C 348 nt2□□□□□ -2.09
RRN9P53437 SOK2YMR016C 2358 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 ELG1YOR144C 2376 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YDL068WYDL068W 330 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YGR018CYGR018C 330 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YLR202CYLR202C 327 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RPS17AYML024W 411 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 ICY1YMR195W 384 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 PBI2YNL015W 228 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 DGR1YNL130C-A 147 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RSA1YPL193W 1146 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 IRC16YPR038W 360 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 VTC3YPL019C 2508 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 MGM1YOR211C 2646 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN9P53437 IST2YBR086C 2841 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 SIR4YDR227W 4077 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 MXR1YER042W 555 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 PAU14YIL176C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 PAU1YJL223C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 SNC1YAL030W 354 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 DDR48YMR173W 1293 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 LSM7YNL147W 348 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 TOR2YKL203C 7425 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 APL5YPL195W 2799 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN9P53437 BRE1YDL074C 2103 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YLR456WYLR456W 615 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 VTI1YMR197C 654 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 GAL7YBR018C 1101 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 UFD4YKL010C 4452 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 SAP190YKR028W 3102 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 BUB1YGR188C 3066 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN9P53437 YJL016WYJL016W 1686 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 SMC6YLR383W 3345 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 SCH9YHR205W 2475 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 NUP82YJL061W 2142 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 CTK3YML112W 891 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 ATX2YOR079C 942 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 MPH1YIR002C 2982 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 KAP123YER110C 3342 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN9P53437 BFA1YJR053W 1725 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN9P53437 YFR016CYFR016C 3702 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN9P53437 SPE1YKL184W 1401 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN9P53437 GCN4YEL009C 846 nt1.95□□□□□ -2.1
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