Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEFLP07196 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEFLP07196 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEFLP07196 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFLP07196 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFLP07196 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFLP07196 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEFLP07196 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEFLP07196 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms