Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDY1Q9Y6F8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDY1Q9Y6F8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY1Q9Y6F8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDY1Q9Y6F8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY1Q9Y6F8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDY1Q9Y6F8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms