Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GTF3C3Q9Y5Q9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
GTF3C3Q9Y5Q9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms