Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D4Q9Y2X8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2D4Q9Y2X8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D4Q9Y2X8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2D4Q9Y2X8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D4Q9Y2X8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms