Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T4

PPP2R2C, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2CQ9Y2T4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms