Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MYO6Q9UM54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO6Q9UM54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYO6Q9UM54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYO6Q9UM54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO6Q9UM54 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms