Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TPCN1Q9ULQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TPCN1Q9ULQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TPCN1Q9ULQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPCN1Q9ULQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPCN1Q9ULQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPCN1Q9ULQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPCN1Q9ULQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPCN1Q9ULQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
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