Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA8BQ9ULN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA8BQ9ULN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA8BQ9ULN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA8BQ9ULN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA8BQ9ULN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNMA8BQ9ULN7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA8BQ9ULN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms