Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SARDHQ9UL12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SARDHQ9UL12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SARDHQ9UL12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARDHQ9UL12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARDHQ9UL12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARDHQ9UL12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SARDHQ9UL12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARDHQ9UL12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms