Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM4Q9UKN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM4Q9UKN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRDM4Q9UKN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM4Q9UKN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM4Q9UKN5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms