Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PARP4Q9UKK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PARP4Q9UKK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PARP4Q9UKK3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PARP4Q9UKK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PARP4Q9UKK3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PARP4Q9UKK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PARP4Q9UKK3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PARP4Q9UKK3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PARP4Q9UKK3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PARP4Q9UKK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PARP4Q9UKK3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms