Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGEF1Q9UJ41 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RABGEF1Q9UJ41 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGEF1Q9UJ41 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGEF1Q9UJ41 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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