Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC7A8Q9UHI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A8Q9UHI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A8Q9UHI5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC7A8Q9UHI5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC7A8Q9UHI5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC7A8Q9UHI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms