Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHA6Q9UF33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHA6Q9UF33 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHA6Q9UF33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHA6Q9UF33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHA6Q9UF33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA6Q9UF33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA6Q9UF33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA6Q9UF33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHA6Q9UF33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms