Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MBD2Q9UBB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD2Q9UBB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD2Q9UBB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD2Q9UBB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MBD2Q9UBB5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms