Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS2Q9NYR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKIRAS2Q9NYR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms