Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC4BQ9NT99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC4BQ9NT99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC4BQ9NT99 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC4BQ9NT99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC4BQ9NT99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC4BQ9NT99 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC4BQ9NT99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC4BQ9NT99 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC4BQ9NT99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC4BQ9NT99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms