Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTN4Q9NQC3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RTN4Q9NQC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTN4Q9NQC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RTN4Q9NQC3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTN4Q9NQC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms