Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA8Q9NP80 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNPLA8Q9NP80 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA8Q9NP80 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA8Q9NP80 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA8Q9NP80 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms