Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLSPNQ9HAW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLSPNQ9HAW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLSPNQ9HAW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLSPNQ9HAW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CLSPNQ9HAW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLSPNQ9HAW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLSPNQ9HAW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLSPNQ9HAW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 516.2 ms