Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIBC2Q9H4K1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIBC2Q9H4K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIBC2Q9H4K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIBC2Q9H4K1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIBC2Q9H4K1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms