Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3M7

TXNIP, Thioredoxin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNIPQ9H3M7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNIPQ9H3M7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNIPQ9H3M7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNIPQ9H3M7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNIPQ9H3M7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNIPQ9H3M7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNIPQ9H3M7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNIPQ9H3M7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNIPQ9H3M7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNIPQ9H3M7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms