Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA4Q9GZZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GFRA4Q9GZZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GFRA4Q9GZZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GFRA4Q9GZZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms