Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX2Q9BZI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX2Q9BZI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX2Q9BZI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX2Q9BZI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRX2Q9BZI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX2Q9BZI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX2Q9BZI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms