Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SCAPERQ9BY12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SCAPERQ9BY12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.11
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SCAPERQ9BY12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SCAPERQ9BY12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SCAPERQ9BY12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SCAPERQ9BY12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SCAPERQ9BY12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SCAPERQ9BY12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SCAPERQ9BY12 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SCAPERQ9BY12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SCAPERQ9BY12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SCAPERQ9BY12 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SCAPERQ9BY12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAPERQ9BY12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SCAPERQ9BY12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SCAPERQ9BY12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SCAPERQ9BY12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAPERQ9BY12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SCAPERQ9BY12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SCAPERQ9BY12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SCAPERQ9BY12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SCAPERQ9BY12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms