Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLVAPQ9BX97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLVAPQ9BX97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLVAPQ9BX97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLVAPQ9BX97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PLVAPQ9BX97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PLVAPQ9BX97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms