Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSG1Q9BU20 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RSG1Q9BU20 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSG1Q9BU20 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSG1Q9BU20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms