Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPK3BQ9BT76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPK3BQ9BT76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UPK3BQ9BT76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms