Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRG3Q99928 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABRG3Q99928 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRG3Q99928 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRG3Q99928 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GABRG3Q99928 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABRG3Q99928 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms