Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A1Q96NT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC46A1Q96NT5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC46A1Q96NT5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC46A1Q96NT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC46A1Q96NT5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms