Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNDC3BQ96NL0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC3BQ96NL0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNDC3BQ96NL0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC3BQ96NL0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.2 ms