Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF34Q969K3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF34Q969K3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF34Q969K3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF34Q969K3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF34Q969K3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms