Protein–RNA interactions for Protein: Q92979

EMG1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMG1Q92979 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMG1Q92979 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMG1Q92979 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMG1Q92979 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms