Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB1CQ92928 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1CQ92928 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1CQ92928 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1CQ92928 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1CQ92928 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms