Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX1Q92786 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX1Q92786 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX1Q92786 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX1Q92786 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX1Q92786 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1319.9 ms