Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ2

NUDCD2, NudC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD2Q8WVJ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD2Q8WVJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD2Q8WVJ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD2Q8WVJ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD2Q8WVJ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD2Q8WVJ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD2Q8WVJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDCD2Q8WVJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD2Q8WVJ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD2Q8WVJ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDCD2Q8WVJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD2Q8WVJ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD2Q8WVJ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD2Q8WVJ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD2Q8WVJ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms