Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNIH3Q8TBE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNIH3Q8TBE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNIH3Q8TBE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNIH3Q8TBE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNIH3Q8TBE1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNIH3Q8TBE1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNIH3Q8TBE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNIH3Q8TBE1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms