Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNL1Q8NG31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNL1Q8NG31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNL1Q8NG31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNL1Q8NG31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNL1Q8NG31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNL1Q8NG31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNL1Q8NG31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms