Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX31Q8N9S9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX31Q8N9S9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX31Q8N9S9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX31Q8N9S9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms