Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYP4X1Q8N118 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4X1Q8N118 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4X1Q8N118 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4X1Q8N118 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP4X1Q8N118 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4X1Q8N118 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms